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    value: "assertion"
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    value: "dataset"
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}
rows {
  name {
    value: "Dataset"
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      lex: "2026-03-17T16:56:38.233861+00:00"
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    value: "workflowsummary"
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    }
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    value: "hasWorkflowRun"
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rows {
  name {
    value: "workflowrun"
  }
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    p_iri {
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    }
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    value: "Parameterization"
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    value: "parameterIndex"
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    }
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    value: "parameterValue"
  }
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rows {
  quad {
    p_iri {
    }
    o_literal {
      lex: "-R \'@RG\\tID:{sample}\\tSM:{sample}\'"
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    value: "param-bwa_mem-2"
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rows {
  quad {
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    }
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    }
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      prefix_id: 4
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    }
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
    }
    o_literal {
      lex: "2"
      datatype: 2
    }
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
    }
    o_literal {
      lex: "samtools"
    }
  }
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  name {
    value: "param-bwa_mem-3"
  }
}
rows {
  quad {
    s_iri {
      prefix_id: 9
      name_id: 26
    }
    p_iri {
      prefix_id: 12
      name_id: 10
    }
    o_iri {
      prefix_id: 4
      name_id: 22
    }
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
    }
    o_literal {
      lex: "3"
      datatype: 2
    }
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
    }
    o_literal {
      lex: "coordinate"
    }
  }
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    value: "param-bwa_mem-4"
  }
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  quad {
    s_iri {
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      name_id: 27
    }
    p_iri {
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    }
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      prefix_id: 4
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    }
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
    }
    o_literal {
      lex: "4"
      datatype: 2
    }
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
    }
    o_literal {
    }
  }
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rows {
  name {
    value: "param-samtools_index-1"
  }
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rows {
  quad {
    s_iri {
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    }
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    }
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    }
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
    }
    o_literal {
      lex: "1"
      datatype: 2
    }
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
    }
    o_literal {
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "rule-all"
  }
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rows {
  name {
    value: "WorkflowRule"
  }
}
rows {
  quad {
    s_iri {
      prefix_id: 9
      name_id: 29
    }
    p_iri {
      prefix_id: 12
      name_id: 10
    }
    o_iri {
      prefix_id: 4
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    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "hasSoftwarePackage"
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
    }
    o_literal {
      lex: "all"
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "ruleName"
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "rule-bcftools_call"
  }
}
rows {
  quad {
    s_iri {
      prefix_id: 9
    }
    p_iri {
      prefix_id: 12
      name_id: 10
    }
    o_iri {
      prefix_id: 4
      name_id: 30
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "hasOutput"
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
      name_id: 34
    }
    o_literal {
      lex: "calls/all.vcf"
    }
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
      name_id: 31
    }
    o_literal {
      lex: "envs/bcftools.yml"
    }
  }
}
rows {
  quad {
    o_literal {
      lex: "shell"
    }
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
    }
    o_literal {
      lex: "bcftools_call"
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "rule-bwa_mem"
  }
}
rows {
  quad {
    s_iri {
      prefix_id: 9
      name_id: 35
    }
    p_iri {
      prefix_id: 12
      name_id: 10
    }
    o_iri {
      prefix_id: 4
      name_id: 30
    }
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
      name_id: 34
    }
    o_literal {
      lex: "sorted_reads/A.bam"
    }
  }
}
rows {
  quad {
    o_literal {
      lex: "sorted_reads/B.bam"
    }
  }
}
rows {
  quad {
    o_literal {
      lex: "sorted_reads/{sample}.bam"
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "hasParameterization"
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
      name_id: 36
    }
    o_iri {
      prefix_id: 9
      name_id: 21
    }
  }
}
rows {
  quad {
    o_iri {
      name_id: 25
    }
  }
}
rows {
  quad {
    o_iri {
    }
  }
}
rows {
  quad {
    o_iri {
    }
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
      prefix_id: 4
      name_id: 31
    }
    o_literal {
      lex: "envs/bwa.yml"
    }
  }
}
rows {
  quad {
    o_literal {
      lex: "v8.1.1/bio/bwa/mem"
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "parametersJSON"
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
      name_id: 37
    }
    o_literal {
      lex: "[\"-R \'@RG\\\\tID:{sample}\\\\tSM:{sample}\'\", \"samtools\", \"coordinate\", \"\"]"
    }
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
      name_id: 32
    }
    o_literal {
      lex: "bwa_mem"
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "rule-plot_positions"
  }
}
rows {
  quad {
    s_iri {
      prefix_id: 9
      name_id: 38
    }
    p_iri {
      prefix_id: 12
      name_id: 10
    }
    o_iri {
      prefix_id: 4
      name_id: 30
    }
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
      name_id: 34
    }
    o_literal {
      lex: "calls/positions.png"
    }
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
      name_id: 31
    }
    o_literal {
      lex: "envs/matplotlib.yml"
    }
  }
}
rows {
  quad {
    o_literal {
      lex: "scripts/plot-positions.py"
    }
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
    }
    o_literal {
      lex: "plot_positions"
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "rule-plot_quals"
  }
}
rows {
  quad {
    s_iri {
      prefix_id: 9
      name_id: 39
    }
    p_iri {
      prefix_id: 12
      name_id: 10
    }
    o_iri {
      prefix_id: 4
      name_id: 30
    }
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
      name_id: 34
    }
    o_literal {
      lex: "calls/quals.png"
    }
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
      name_id: 31
    }
    o_literal {
      lex: "envs/matplotlib.yml"
    }
  }
}
rows {
  quad {
    o_literal {
      lex: "scripts/plot-quals.py"
    }
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
    }
    o_literal {
      lex: "plot_quals"
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "rule-samtools_index"
  }
}
rows {
  quad {
    s_iri {
      prefix_id: 9
      name_id: 40
    }
    p_iri {
      prefix_id: 12
      name_id: 10
    }
    o_iri {
      prefix_id: 4
      name_id: 30
    }
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
      name_id: 34
    }
    o_literal {
      lex: "sorted_reads/A.bam.bai"
    }
  }
}
rows {
  quad {
    o_literal {
      lex: "sorted_reads/B.bam.bai"
    }
  }
}
rows {
  quad {
    o_literal {
      lex: "sorted_reads/{sample}.bam.bai"
    }
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
      name_id: 36
    }
    o_iri {
      prefix_id: 9
      name_id: 28
    }
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
      prefix_id: 4
      name_id: 31
    }
    o_literal {
      lex: "envs/samtools.yml"
    }
  }
}
rows {
  quad {
    o_literal {
      lex: "v5.7.0/bio/samtools/index"
    }
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
      name_id: 37
    }
    o_literal {
      lex: "[\"\"]"
    }
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
      name_id: 32
    }
    o_literal {
      lex: "samtools_index"
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "WorkflowRun"
  }
}
rows {
  quad {
    s_iri {
      prefix_id: 9
      name_id: 20
    }
    p_iri {
      prefix_id: 12
      name_id: 10
    }
    o_iri {
      prefix_id: 4
      name_id: 41
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "configJSON"
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
    }
    o_literal {
      lex: "{\"samples\": {\"A\": \"data/samples/A.fastq\", \"B\": \"data/samples/B.fastq\"}}"
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "configfile"
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
    }
    o_literal {
      lex: "config/config.yaml"
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "dagSource"
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
    }
    o_literal {
      lex: "Snakefile"
    }
  }
}
rows {
  quad {
    o_literal {
      lex: "config/config.yaml"
    }
  }
}
rows {
  quad {
    o_literal {
      lex: "envs/bcftools.yml"
    }
  }
}
rows {
  quad {
    o_literal {
      lex: "envs/bwa.yml"
    }
  }
}
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  quad {
    o_literal {
      lex: "envs/matplotlib.yml"
    }
  }
}
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  quad {
    o_literal {
      lex: "envs/samtools.yml"
    }
  }
}
rows {
  quad {
    o_literal {
      lex: "scripts/plot-positions.py"
    }
  }
}
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  quad {
    o_literal {
      lex: "scripts/plot-quals.py"
    }
  }
}
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  name {
    value: "description"
  }
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  quad {
    p_iri {
    }
    o_literal {
    }
  }
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  name {
    value: "hasRule"
  }
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  quad {
    p_iri {
    }
    o_iri {
      prefix_id: 9
      name_id: 29
    }
  }
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  quad {
    o_iri {
      name_id: 33
    }
  }
}
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  quad {
    o_iri {
      name_id: 35
    }
  }
}
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  quad {
    o_iri {
      name_id: 38
    }
  }
}
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  quad {
    o_iri {
    }
  }
}
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  quad {
    o_iri {
    }
  }
}
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  name {
    value: "includedSnakefile"
  }
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  quad {
    p_iri {
      prefix_id: 4
      name_id: 47
    }
    o_literal {
      lex: "/home/meesters/Documents/Teaching/snakemake-hpc-teaching-material/snakemake-tutorial/Snakefile"
    }
  }
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  name {
    value: "mainSnakefile"
  }
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  quad {
    p_iri {
    }
  }
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  name {
    value: "workflowMetadataJSON"
  }
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  quad {
    p_iri {
    }
    o_literal {
      lex: "{}"
    }
  }
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rows {
  name {
    value: "WorkflowSummary"
  }
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  quad {
    s_iri {
      prefix_id: 9
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    }
    p_iri {
      prefix_id: 12
      name_id: 10
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    o_iri {
      prefix_id: 4
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  name {
    value: "numberOfJobs"
  }
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  quad {
    p_iri {
    }
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      lex: "8"
      datatype: 2
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  name {
    value: "numberOfResults"
  }
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rows {
  quad {
    p_iri {
    }
    o_literal {
      lex: "2"
      datatype: 2
    }
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rows {
  name {
    value: "numberOfRules"
  }
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rows {
  quad {
    p_iri {
    }
    o_literal {
      lex: "6"
      datatype: 2
    }
  }
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  name {
    value: "generatedAtTime"
  }
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  quad {
    s_iri {
      prefix_id: 9
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    }
    p_iri {
      prefix_id: 6
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    }
    o_literal {
      lex: "2026-03-17T17:56:38.267634"
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    g_iri {
      prefix_id: 9
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    }
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  name {
    value: "wasAttributedTo"
  }
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rows {
  name {
    value: "0000-0003-2408-7588"
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rows {
  quad {
    p_iri {
      prefix_id: 6
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    o_iri {
      prefix_id: 5
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  }
}
rows {
  name {
    value: "created"
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  quad {
    s_iri {
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    }
    p_iri {
      prefix_id: 1
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    }
    o_literal {
      lex: "2026-03-17T16:56:38.233861+00:00"
      datatype: 1
    }
    g_iri {
      prefix_id: 9
      name_id: 9
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "creator"
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}
rows {
  quad {
    p_iri {
      prefix_id: 1
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    }
    o_iri {
      prefix_id: 5
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    }
  }
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rows {
  name {
    value: "hasNanopubType"
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}
rows {
  quad {
    p_iri {
      prefix_id: 3
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    }
    o_iri {
      prefix_id: 8
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    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "label"
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
      prefix_id: 7
      name_id: 60
    }
    o_literal {
      lex: "Snakemake workflow metadata: https://w3id.org/np/RAOBjU_aTRgW5zb2MFGvZPAXBZegQRzVoUU-aSGQFpxh4"
    }
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
      prefix_id: 6
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    }
    o_literal {
      lex: "2026-03-17T17:56:38.267634"
      datatype: 1
    }
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}
rows {
  quad {
    p_iri {
    }
    o_iri {
      prefix_id: 5
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "sig"
  }
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rows {
  name {
    value: "hasAlgorithm"
  }
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rows {
  quad {
    s_iri {
      prefix_id: 9
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      prefix_id: 3
    }
    o_literal {
      lex: "RSA"
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rows {
  name {
    value: "hasPublicKey"
  }
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rows {
  quad {
    p_iri {
    }
    o_literal {
      lex: "MIIBIjANBgkqhkiG9w0BAQEFAAOCAQ8AMIIBCgKCAQEAkOFUnnRCp/k9/0ugvx8zQJ+Qc675W1Ug6F839+xvJ2QsSBu4iOJ1O2kJCmb3tALp3gJOt8sffRot3VrfY1hbgXxL7BVtDsfHHmXVff4YCeg5Ycdn5cDpLawDpAdYwMhK0LwIkZ3fwH9/o9JniYKXLV/jpF9bMKyiw/6tqlCHaMW1r8gzZzoxVIAakwvlABoY0iNoToLTlBRXEI4mLUNjDMnMwQgfh1KXMxMruNjW3wJyeDEIfa2ooAt0E4CRM9pkrEb37NzD9Jz8aSUFFY6BvIxF4ixK7rm6IUDvQ76LqXkEmgSeRv1kw7gnCe9wV/wHd0ZeW4heoBXmLHX3MvHfjwIDAQAB"
    }
  }
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rows {
  name {
    value: "hasSignature"
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
    }
    o_literal {
      lex: "ZFhAdflCQRCWylgIb3dtDUPw1md1QASvL7su2QKzIjUbDEWiFW7bx3mlPfq5Mlil6aHjNH3RMeQ0S1/qB6Noe+M4Z3ZD/EBeHCeTRSdVB3/mhRjLnRX4rcitkeKw4vaaL7RND2AneAquAtAnT+qaK2pQmUvzh7W8M8dZJP1eCftab2g8QMhJOwQ1T1OQaHQHPFzwsUrLwcdp8hbt8wl6vNNzpt/ZQidfedlXB9H7xvZl1a6n+Ud0bnDGJ7UXSHyHMQeob1p+j+Ctgfwl5bB0qXiGH2FerOqc7/NHO2YnrmPbaB3wupfQsnDDPc3BLLWjoQKkyainOvMkFv8DNGfscg=="
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "hasSignatureTarget"
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
    }
    o_iri {
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rows {
  name {
    value: "signedBy"
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
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